اولین موزه منطقه ای در استان سیستان و بلوچستان به نام موزه منطقه ای زاهدان در سال 1390 افتتاح شده است. در این موزه منطقه ای می توان آثاری از یافته های باستان شناسی کرمان، سیستان و بلوچستان و خراسان جنوبی را مشاهده کرد.

موزه منطقه ای جنوب شرق ایران که در زاهدان قرار دارد، شامل بخش های متعدد مردم شناسی، بوم شناسی، باستان شناسی، کتابخانه و چندین تالار می باشد.

موزه زاهدان یکی از بزرگترین موزه‌های بزرگ تاریخی، فرهنگی و هنری منطقه ای در جنوب شرق ایران است که در مرکز استان سیستان و بلوچستان قرار دارد. در این موزه آثار باستانی استان، پوشش محلی استان، غذاهای محلی استان و گونه های جانوران استان به نمایش گذاشته شده است.

این موزه با ۱۵۰۰۰ مترمربع مساحت، دارای ۱۱۰۰۰  مترمربع زیر بنا است که در ۵ طبقه ساخته شده است. برای دیدن این موزه باید رمپ یا مسیری شیب دار را طی کرد مسیری که در آن هم آثار را می‌توان دید و هم یک طبقه بالا رفت بدون اینکه یک پله طی شود، اما در مسیر برگشت برای سهولت رفت و آمد بازدید کنندگان پله کار گذاشته شده است معماری این موزه برگرفته از قلعه باستانی سب شهرستان سوران بلوچستان است.

این موزه از سه قسمت تشکیل شده است که در بخش باستان شناسی اطلاعاتی شامل مشخصات سایت، محوطه باستانی شهر سوخته، کوه خواجه، دهانه غلامان، اسپیدژ، جیرفت، جنوب خراسان و سایر آثار باستانی – تاریخی منطقه جنوب شرق برای بازدید علاقه‌مندان جمع آوری شده است. از جمله اشیاء به نمایش درآمده آثار حاصل از کاوش‌های باستان شناسی در محوطه‌های باستانی مانند سفالینه ها، اشیاء فلزی، گلی، سنگی، شیشه، تابلو‌های نفیس و کتب خطی است.

از دیگر بخش‌های موزه می‌توان به کتابخانه آن اشاره کرد که شامل کتاب‌های تخصصی با موضوعات میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری با تعداد ۵ هزار جلد است و در کنار واحد اسناد و مدارک که در برگیرنده آرشیو کاملی از عکس، اسلاید، فیلم و اقلام فرهنگی مربوط به منطقه است قرار دارد.